O Estatuto Social da Funep determina em seu art. 43, § 1º e § 2º que as funções na Diretoria Executiva poderão ser remuneradas, de acordo com a legislação aplicável (Lei Federal 13.151, de 28/07/2015) e com valores definidos em ata de reunião do Conselho Curador (ata da reunião nr. 205, de 05/09/2018).