A Fundação de Apoio a Pesquisa, Ensino e Extensão - FUNEP é fundação de direito privado, de fins não econômicos e é de apoio à universidade.

Foi criada em 28 de novembro de 1979 e instituída por meio da escritura pública lavrada nas notas do 2º Cartório de Notas e Ofício de Justiça da Comarca de Jaboticabal, no livro 366, fls. 323, em 16.02.1981. O Estatuto registrado no Oficial de Registro de Pessoas Jurídicas de Jaboticabal, sob nº 1.496, em 06.04.2004.

A FUNEP é conveniada com a Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" - Unesp por meio de um programa de cooperação acadêmica nas áreas de suas atuações e de interesses comuns, especialmente com a Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias - FCAV, Câmpus de Jaboticabal/SP.

A FUNEP atua na criação de métodos facilitadores para integrar a universidade e a docência nas atividades científicas, educacionais, culturais, ambientais e assistenciais.

A FUNEP viabiliza o desenvolvimento de projetos de pesquisa; apoia a realização de cursos de especialização e de extensão universitária, simpósios, seminários, conferências e trabalhos por meio de publicações especializadas.

A FUNEP está reconhecida como entidade de utilidade pública na Federação desde 18.12.2001, por meio da Portaria nº 1.123 do Ministério da Justiça; no Estado de São Paulo desde 23.11.1995, por meio da Lei nº 9.191/95 e no município de Jaboticabal desde 10.12.1985, por meio da Lei nº 1.700/85.